A matéria é tudo o que tem massa e que ocupa espaço. O simulador demonstra que as coisas feitas de matéria podem ser vivas ou não. Explica como é que se sabe quando uma matéria é viva.
Permite ao aluno explorar um o microscópio nas suas partes constituintes, associando a cada parte do modelo a sua designação e obtendo informação sobre a sua função.